MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-12

Total Repeats: 777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017396	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017396	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387825582
3	NC_017396	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387825582
4	NC_017396	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
5	NC_017396	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825582
6	NC_017396	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825582
7	NC_017396	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825582
8	NC_017396	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825582
9	NC_017396	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825582
10	NC_017396	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387825582
11	NC_017396	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825582
12	NC_017396	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
13	NC_017396	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825582
14	NC_017396	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825582
15	NC_017396	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825582
16	NC_017396	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825582
17	NC_017396	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387825582
18	NC_017396	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825582
19	NC_017396	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825582
20	NC_017396	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825582
21	NC_017396	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387825582
22	NC_017396	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825582
23	NC_017396	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825582
24	NC_017396	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825582
25	NC_017396	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825582
26	NC_017396	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825582
27	NC_017396	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825582
28	NC_017396	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825583
29	NC_017396	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825583
30	NC_017396	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825583
31	NC_017396	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825583
32	NC_017396	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387825583
33	NC_017396	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387825583
34	NC_017396	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387825583
35	NC_017396	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387825583
36	NC_017396	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825583
37	NC_017396	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825583
38	NC_017396	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387825583
39	NC_017396	CAA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825584
40	NC_017396	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	387825584
41	NC_017396	TGG	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825584
42	NC_017396	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825584
43	NC_017396	TGG	3	9	2274	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825584
44	NC_017396	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	387825584
45	NC_017396	AAGA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	387825584
46	NC_017396	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	387825584
47	NC_017396	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	387825584
48	NC_017396	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	387825584
49	NC_017396	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825584
50	NC_017396	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825585
51	NC_017396	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	387825585
52	NC_017396	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825585
53	NC_017396	AGT	2	6	2815	2820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825585
54	NC_017396	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	387825585
55	NC_017396	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825585
56	NC_017396	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	387825585
57	NC_017396	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	387825585
58	NC_017396	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	387825585
59	NC_017396	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825585
60	NC_017396	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825585
61	NC_017396	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	387825585
62	NC_017396	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	387825585
63	NC_017396	TGG	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825585
64	NC_017396	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017396	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	387825586
66	NC_017396	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825586
67	NC_017396	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	387825586
68	NC_017396	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825586
69	NC_017396	TGG	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825586
70	NC_017396	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825586
71	NC_017396	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825586
72	NC_017396	TAG	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825586
73	NC_017396	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825586
74	NC_017396	GCAAA	2	10	3867	3876	60 %	0 %	20 %	20 %	387825586
75	NC_017396	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	387825586
76	NC_017396	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825586
77	NC_017396	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017396	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825587
79	NC_017396	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825587
80	NC_017396	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825587
81	NC_017396	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825587
82	NC_017396	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	387825587
83	NC_017396	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825587
84	NC_017396	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825587
85	NC_017396	TACAA	2	10	4213	4222	60 %	20 %	0 %	20 %	387825587
86	NC_017396	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	387825587
87	NC_017396	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825587
88	NC_017396	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825587
89	NC_017396	ATT	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825587
90	NC_017396	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825587
91	NC_017396	GCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825587
92	NC_017396	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825587
93	NC_017396	GTG	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825587
94	NC_017396	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825587
95	NC_017396	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825587
96	NC_017396	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825587
97	NC_017396	GCA	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825587
98	NC_017396	AGT	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825587
99	NC_017396	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825587
100	NC_017396	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825587
101	NC_017396	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825587
102	NC_017396	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	387825587
103	NC_017396	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	387825587
104	NC_017396	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825587
105	NC_017396	ACAAGC	2	12	4962	4973	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387825588
106	NC_017396	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825588
107	NC_017396	TTAC	2	8	5149	5156	25 %	50 %	0 %	25 %	387825588
108	NC_017396	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825588
109	NC_017396	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825588
110	NC_017396	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	387825588
111	NC_017396	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825588
112	NC_017396	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825588
113	NC_017396	TAG	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825588
114	NC_017396	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825588
115	NC_017396	G	6	6	5295	5300	0 %	0 %	100 %	0 %	387825588
116	NC_017396	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	387825588
117	NC_017396	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	387825588
118	NC_017396	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825589
119	NC_017396	TTC	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825589
120	NC_017396	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	387825589
121	NC_017396	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825589
122	NC_017396	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825590
123	NC_017396	TAG	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825590
124	NC_017396	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	387825590
125	NC_017396	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825590
126	NC_017396	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	387825590
127	NC_017396	CTA	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825590
128	NC_017396	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	387825590
129	NC_017396	GTA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825590
130	NC_017396	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825590
131	NC_017396	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825590
132	NC_017396	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825591
133	NC_017396	ATC	2	6	6263	6268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825591
134	NC_017396	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825591
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